224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0988 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
294 aa  597  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30.18 
 
 
206 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
190 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 
202 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
190 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  26.9 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  28.24 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  29.7 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  26.52 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
212 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.41 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  36.13 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  28.82 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  32.9 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  33.66 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  30 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  26.95 
 
 
193 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  36.28 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  30.49 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0785  iron-sulfur flavoprotein, putative  32.8 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0958732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  29.58 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.42 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  34.45 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
210 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
193 aa  67  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
220 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  26.16 
 
 
201 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  27.06 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  28.39 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  31.64 
 
 
186 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  35.88 
 
 
189 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  26.63 
 
 
179 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  33.33 
 
 
195 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
179 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 
208 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  26.29 
 
 
200 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
224 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  31.45 
 
 
189 aa  63.2  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  32.61 
 
 
195 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  31.37 
 
 
182 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  28.39 
 
 
204 aa  62.4  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  23.31 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
189 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  25.93 
 
 
216 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
185 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
182 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
191 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
197 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  24.51 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 
189 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  28.97 
 
 
199 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
197 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  27.34 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
214 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  26.96 
 
 
187 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
197 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  33.33 
 
 
183 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
179 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  25.24 
 
 
217 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  24.27 
 
 
228 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  29.49 
 
 
208 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2521  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
230 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.34 
 
 
540 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  21.97 
 
 
217 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  24.51 
 
 
218 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 
197 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
173 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
178 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.47 
 
 
344 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  27.62 
 
 
194 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
172 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 
197 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  28.67 
 
 
199 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  41.41 
 
 
190 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
213 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  23.16 
 
 
191 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 
191 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  36.73 
 
 
178 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>