More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1378 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  53.8 
 
 
186 aa  217  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  43.17 
 
 
182 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  39.56 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  37.17 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  39.63 
 
 
189 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  40.96 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  37.93 
 
 
195 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.61 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  36.55 
 
 
200 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  41.45 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  51.92 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  47.24 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
186 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  49.04 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
206 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  42.64 
 
 
184 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
217 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  41.8 
 
 
217 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
206 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
210 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  43.69 
 
 
194 aa  104  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
186 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
208 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  47.12 
 
 
217 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  46.77 
 
 
217 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  42.72 
 
 
193 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  42.72 
 
 
193 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  31.46 
 
 
180 aa  101  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 
218 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  34.2 
 
 
197 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  42.72 
 
 
193 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  33.54 
 
 
172 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
183 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  49.04 
 
 
217 aa  98.2  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
197 aa  97.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  32.16 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  44.12 
 
 
228 aa  95.5  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  34.9 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  31.65 
 
 
190 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  39.86 
 
 
207 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
223 aa  94.4  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  32.37 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  34.21 
 
 
200 aa  94  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  33.63 
 
 
190 aa  92  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  43.4 
 
 
216 aa  92  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  40.57 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  38.17 
 
 
224 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  37.96 
 
 
202 aa  88.6  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  38.73 
 
 
236 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
197 aa  87  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
191 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
220 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  29.05 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  28.07 
 
 
179 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  31.34 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  29.2 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  34.82 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
224 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
208 aa  84.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  27.98 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  28.8 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  28.92 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  32.45 
 
 
211 aa  82  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  26.46 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  27.89 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  37.76 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  23.94 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2521  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
230 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>