More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1035 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  92.35 
 
 		 186 aa  355  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  89.25 
 
 		 186 aa  341  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  33.7 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  45.38 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  42.57 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  33.69 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  33.51 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  41.86 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.77 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  30.26 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  41.58 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  35.6 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  38.57 
 
 		 220 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  43.56 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 		 220 aa  92  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 224 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  31.12 
 
 		 208 aa  91.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  40.16 
 
 		 190 aa  91.3  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  40.16 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  34.84 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 		 198 aa  88.2  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 		 199 aa  88.2  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.26 
 
 		 321 aa  88.2  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 		 211 aa  87.8  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  45.28 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 		 220 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  33.58 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  39.01 
 
 		 191 aa  84.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  42.27 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  32.85 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  36.28 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  38.28 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  38.18 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  29.92 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  31.05 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  35.66 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  32.85 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  29.33 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  29.1 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  26.42 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>