247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1178 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 223 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  81.52 
 
 		 211 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  61.14 
 
 		 211 aa  299  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  60.66 
 
 		 211 aa  295  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  62.09 
 
 		 211 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  60.19 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  51.18 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  50.8 
 
 		 191 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  46.45 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  49.2 
 
 		 191 aa  194  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  46.24 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  47.17 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 191 aa  188  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  47.06 
 
 		 190 aa  187  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  45.33 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  48.13 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  44.92 
 
 		 191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  46.5 
 
 		 204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  43.85 
 
 		 191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  45.37 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  44.86 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  46.52 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  43.6 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  43.5 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  42.78 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  45.95 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 		 190 aa  171  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  44.68 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  46.51 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  45.58 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  42.71 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  44.08 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  40.11 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 		 190 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 194 aa  159  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  42.7 
 
 		 204 aa  158  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 		 205 aa  158  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  38.39 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  38.27 
 
 		 195 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  38.04 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 		 194 aa  102  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 193 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  27.69 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  27.27 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  30.87 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  30.23 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  25.27 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  28.88 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 186 aa  72  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  34.4 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  36.61 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  34.82 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  31.73 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  27.89 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  29.68 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  33.93 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  26.06 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  28.64 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  30.51 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3676  NADPH-dependent FMN reductase  25.89 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  26.34 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  25.27 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  34.51 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>