245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1057 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  94.21 
 
 
190 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  93.16 
 
 
190 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  70.37 
 
 
190 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  60.53 
 
 
191 aa  240  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  57.67 
 
 
191 aa  227  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  56.15 
 
 
188 aa  216  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  54.74 
 
 
191 aa  215  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  57.37 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  55.56 
 
 
204 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  55.79 
 
 
193 aa  210  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  55.79 
 
 
199 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  54.74 
 
 
191 aa  208  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  54.74 
 
 
199 aa  207  6e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  52.91 
 
 
193 aa  201  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  52.38 
 
 
198 aa  200  8e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  50.26 
 
 
191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  51.87 
 
 
211 aa  197  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  48.69 
 
 
192 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  48.42 
 
 
200 aa  190  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  50.53 
 
 
206 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  50.27 
 
 
204 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  48.95 
 
 
192 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  46.6 
 
 
192 aa  186  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  47.12 
 
 
194 aa  185  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  48.35 
 
 
207 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 
211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 
211 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  47.22 
 
 
205 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
211 aa  164  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  41.05 
 
 
208 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
194 aa  159  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  46.56 
 
 
194 aa  157  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  44.15 
 
 
189 aa  157  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  43.85 
 
 
189 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 
223 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 
208 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  40.84 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  38.71 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  41.49 
 
 
211 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  32.63 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
194 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  37.11 
 
 
193 aa  101  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  39.37 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  34.21 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
233 aa  91.3  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  40.16 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  45.1 
 
 
186 aa  89  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  31.48 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  44.66 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
221 aa  85.5  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  29.9 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  30.37 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  37.4 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  42.16 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  37.14 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  34.53 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  32.35 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  31.39 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>