242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0308 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
204 aa  418  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  62.56 
 
 
208 aa  288  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  65 
 
 
203 aa  283  9e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  59.2 
 
 
204 aa  262  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  42.05 
 
 
202 aa  165  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  42.29 
 
 
195 aa  159  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 
212 aa  141  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  34.5 
 
 
200 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
209 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
199 aa  118  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  38.22 
 
 
208 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 
190 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 
190 aa  104  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 
201 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
190 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
191 aa  98.6  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.33 
 
 
321 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 
199 aa  95.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  38.97 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  29.83 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  34.84 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
193 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  26.82 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  32.56 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  34.92 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  39.39 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  37.4 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  28.73 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  28.39 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  31.03 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  35.29 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  31.53 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  30.88 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  30.58 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  32.33 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  31 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  29.61 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  27.62 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  35.64 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  37.62 
 
 
195 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  33.98 
 
 
178 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  33.9 
 
 
192 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
224 aa  61.2  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
263 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  27.5 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  30.23 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2521  NADPH-dependent FMN reductase  33.63 
 
 
230 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  30.57 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>