231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2979 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 
191 aa  222  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  58.73 
 
 
190 aa  221  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  55.56 
 
 
191 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  54.21 
 
 
198 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  54.26 
 
 
188 aa  211  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  55.56 
 
 
190 aa  211  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  55.56 
 
 
190 aa  209  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  53.97 
 
 
193 aa  208  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  55.56 
 
 
190 aa  207  7e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 
191 aa  207  7e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  52.36 
 
 
191 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  51.28 
 
 
206 aa  204  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  51.03 
 
 
200 aa  205  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  53.48 
 
 
199 aa  204  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  52.94 
 
 
199 aa  204  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  50.8 
 
 
191 aa  204  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  54.95 
 
 
207 aa  203  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  51.81 
 
 
193 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  53.37 
 
 
194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  49 
 
 
204 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50 
 
 
211 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  50.56 
 
 
205 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  47.4 
 
 
192 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  51.31 
 
 
194 aa  184  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  46.88 
 
 
192 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  45.85 
 
 
211 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  46.34 
 
 
211 aa  181  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 
190 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  50.27 
 
 
192 aa  180  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  46.34 
 
 
211 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 
211 aa  174  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  45.79 
 
 
194 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  46.5 
 
 
223 aa  170  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  39.69 
 
 
208 aa  153  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  38.97 
 
 
208 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  37.82 
 
 
195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  41.03 
 
 
207 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  40.44 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  39.02 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  39.68 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  38.54 
 
 
206 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  38.14 
 
 
206 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  35.42 
 
 
206 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
211 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 
211 aa  123  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
210 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  38.58 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  38.58 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  38.86 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 
193 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
189 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  35.03 
 
 
193 aa  101  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 
204 aa  99  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
186 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  31 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  28.04 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  31.34 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  27.98 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  32.81 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  37.62 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  30.07 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  41.05 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  28.88 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  29.61 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.89 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  27.67 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  35.76 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  33.58 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  34.91 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  26.04 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  25.11 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0489  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  35.24 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  27.6 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>