255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0179 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  441  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  75.36 
 
 		 211 aa  350  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  73.93 
 
 		 211 aa  339  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  72.51 
 
 		 211 aa  334  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  61.61 
 
 		 211 aa  289  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  62.09 
 
 		 223 aa  276  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  57.35 
 
 		 208 aa  258  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  54.01 
 
 		 191 aa  224  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  51.32 
 
 		 191 aa  215  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  45.97 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  54.01 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  51.87 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  47.64 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  51.87 
 
 		 190 aa  197  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  47.64 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  48.13 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  47.85 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  48.69 
 
 		 192 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  50.27 
 
 		 190 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  47.57 
 
 		 188 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  45.5 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  46.84 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  46.52 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  44.34 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  43.13 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  47.89 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  44.92 
 
 		 199 aa  185  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  48.96 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  49.2 
 
 		 190 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  45.33 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  43.39 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  45.74 
 
 		 194 aa  177  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  43.13 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  41.05 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  45.41 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  46.26 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  42.18 
 
 		 204 aa  168  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  45.31 
 
 		 194 aa  168  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  38.92 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  38.97 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  41.08 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  40.32 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  36.41 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.36 
 
 		 193 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  34.87 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  30.15 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 		 193 aa  95.1  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 186 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  29.74 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  32.19 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  31.31 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  28.36 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  29.15 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  28.86 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  34.51 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  33.61 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  30.24 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3724  NADPH-dependent FMN reductase  35.17 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  29.76 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  29.56 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  30.63 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>