204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0173 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  100 
 
 		 206 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  65.22 
 
 		 207 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  50.72 
 
 		 206 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  49.76 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 212 aa  218  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  51.66 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  48.82 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  49.76 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  48.56 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  43.13 
 
 		 211 aa  187  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  45.63 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  43.13 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  43.6 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  43.6 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  41.45 
 
 		 193 aa  148  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  41.18 
 
 		 191 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  39.78 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  38.54 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  38.17 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  38.12 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  35.42 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  38.54 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  38.14 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  38.3 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  34.01 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  32.11 
 
 		 190 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  32.24 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 		 189 aa  98.6  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 193 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  26.11 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  27.64 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  26.96 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  31.01 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  29.36 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  30.21 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  28.7 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  31.13 
 
 		 182 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  24.75 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  25.49 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07470  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  29.36 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  29.36 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  27.74 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  28.44 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  29.45 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  31.31 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>