240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0018 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
228 aa  480  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  71.5 
 
 
217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  69.86 
 
 
217 aa  319  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  68.69 
 
 
217 aa  315  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  69.19 
 
 
214 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  69.19 
 
 
214 aa  308  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  60.56 
 
 
216 aa  267  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  55.35 
 
 
222 aa  259  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  58.49 
 
 
218 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  53.45 
 
 
236 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  51.15 
 
 
216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  52.31 
 
 
217 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  51.9 
 
 
216 aa  228  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  48.8 
 
 
217 aa  214  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  49.53 
 
 
216 aa  211  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  41.12 
 
 
212 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  36.49 
 
 
211 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00760  hypothetical protein  38.03 
 
 
211 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 
186 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  42.74 
 
 
200 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  42.59 
 
 
200 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  42.72 
 
 
189 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  44.12 
 
 
185 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 
206 aa  95.5  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.17 
 
 
193 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 
188 aa  92.4  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
182 aa  91.7  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  40.71 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 
239 aa  88.2  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  31.16 
 
 
202 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
194 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  39.82 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  36.97 
 
 
173 aa  85.1  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
193 aa  85.1  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  42.72 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  40.78 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  40.37 
 
 
191 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  41.75 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  41.75 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  39.25 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
222 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  37.74 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  32.82 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
189 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  40.2 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  33.63 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  37.74 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  35.04 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  33.64 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  36.54 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  25.69 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
211 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  34.29 
 
 
202 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
188 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>