237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0130 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
224 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  47.48 
 
 
239 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  43.1 
 
 
263 aa  202  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.82 
 
 
540 aa  118  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  31 
 
 
250 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  30.09 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.75 
 
 
344 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 
562 aa  95.5  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.66 
 
 
206 aa  89.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
188 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
172 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30.88 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  41.28 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  31.05 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  36.15 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  35.37 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  34.19 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  24.74 
 
 
190 aa  79  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  30.81 
 
 
195 aa  79  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  25.52 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  27.55 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  33.08 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  35.65 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  38.24 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  36.13 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  36.75 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.39 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  36.7 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  26.9 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  33.64 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  30.53 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  36.11 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  32.33 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  31.39 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  27.6 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 
183 aa  72  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  31.54 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  31.34 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  29.65 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  33.83 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2521  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  31.34 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  37.59 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  31.88 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  27.95 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>