246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2158 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
205 aa  424  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  73.6 
 
 
204 aa  322  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  71.78 
 
 
207 aa  318  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  64.65 
 
 
206 aa  279  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  52.94 
 
 
191 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  54.55 
 
 
191 aa  222  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  57.53 
 
 
192 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  55.85 
 
 
192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  54.35 
 
 
190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  53.19 
 
 
194 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  49.47 
 
 
191 aa  208  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  53.48 
 
 
193 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  50.52 
 
 
200 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  51.34 
 
 
191 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  50.27 
 
 
199 aa  203  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  50.27 
 
 
198 aa  202  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  49.73 
 
 
199 aa  201  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  48.95 
 
 
193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  48.91 
 
 
188 aa  193  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  50.56 
 
 
204 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  46.52 
 
 
191 aa  186  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
190 aa  184  8e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  45.45 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  48.33 
 
 
190 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  47.22 
 
 
190 aa  180  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  45.31 
 
 
194 aa  175  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  41.87 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  49.47 
 
 
190 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  42.64 
 
 
211 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  42.13 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  44.32 
 
 
192 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  45.41 
 
 
194 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  40.54 
 
 
211 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.92 
 
 
211 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 
223 aa  148  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 
208 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
208 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
195 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  41.38 
 
 
189 aa  141  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  39.8 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  37.44 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
189 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  34.85 
 
 
206 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
193 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  35.5 
 
 
207 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  34.36 
 
 
193 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
193 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
204 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 
212 aa  104  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 
211 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
193 aa  99  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
210 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 
212 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  35.68 
 
 
197 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  35.11 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 
214 aa  91.3  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.89 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  44.76 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  44.76 
 
 
222 aa  89  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  39.44 
 
 
220 aa  89  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  37.69 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
187 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 
217 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  38.03 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
186 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
186 aa  84.7  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  43.81 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  42.99 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30.64 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  41.41 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  43.14 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  32.24 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  38.03 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  43.14 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  31.66 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  26.37 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>