250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1029 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  94.21 
 
 		 190 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  88.42 
 
 		 190 aa  355  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  68.78 
 
 		 190 aa  244  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  57.89 
 
 		 191 aa  234  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  56.61 
 
 		 191 aa  224  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  55.08 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  53.16 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  56.32 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  55.26 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  55.26 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  54.74 
 
 		 193 aa  210  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  54.21 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  55.56 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  50.79 
 
 		 198 aa  200  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  52.38 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  49.21 
 
 		 191 aa  198  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  50.27 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  48.69 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  48.42 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  50.27 
 
 		 204 aa  187  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  48.11 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  46.6 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  47.89 
 
 		 192 aa  184  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  46.6 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  48.33 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  43.32 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  45.74 
 
 		 194 aa  160  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 		 211 aa  160  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  41.8 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  45.5 
 
 		 194 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 		 223 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  42.25 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 		 206 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  38.17 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 210 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  32.11 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  37.11 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 		 194 aa  101  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  39.37 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  39.37 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  40.16 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  45.63 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  32.11 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  27.89 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  29.24 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  30.21 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  38.17 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  36.29 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  42.16 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  30.64 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  38.1 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 216 aa  72  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  34.53 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>