223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
172 aa  362  1e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  49.68 
 
 
173 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  33.54 
 
 
185 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  33.51 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  34.16 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  31.68 
 
 
200 aa  91.3  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
177 aa  88.6  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
224 aa  84.7  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30.2 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  37.96 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  37.61 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  38.24 
 
 
211 aa  77  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  36.07 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  29.65 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.33 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  31.9 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  31.28 
 
 
194 aa  73.9  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  30.07 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  31.48 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  36.45 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  37.6 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  26.62 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.54 
 
 
321 aa  67.8  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
224 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  28.68 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.46 
 
 
540 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  33.67 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  36.8 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  35.29 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  28.05 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.79 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  35.78 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  36.36 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
206 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  32.38 
 
 
193 aa  63.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  36.17 
 
 
246 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  31.34 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.89 
 
 
344 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
216 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
220 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
214 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
212 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
192 aa  62.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>