207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0080 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  56.12 
 
 
196 aa  237  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  54.87 
 
 
199 aa  234  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  54.31 
 
 
199 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  48 
 
 
200 aa  206  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
206 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
190 aa  118  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
202 aa  111  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  30.93 
 
 
208 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  32.22 
 
 
203 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  28.65 
 
 
200 aa  100  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  29.83 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
192 aa  88.2  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  28.32 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  23.94 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  29.11 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  27.84 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  25.46 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.5 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  26.04 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  34.02 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  33.96 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  25.9 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  28.33 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  25.87 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  26.9 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  28.1 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  29.31 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  31.63 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  26.16 
 
 
294 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  25.44 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  25.44 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  28.68 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  33.65 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  26.7 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.64 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  24.65 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  26.23 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  28.06 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  30.7 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  30.77 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  27.06 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
195 aa  62  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  30.36 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
263 aa  61.6  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
186 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
224 aa  61.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  26.78 
 
 
179 aa  61.2  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  33.65 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  30.58 
 
 
172 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 
216 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  28.03 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>