226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0487 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
199 aa  414  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1497  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.52 
 
 
198 aa  227  9e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.250529  normal  0.118401 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  42.21 
 
 
205 aa  168  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  44.2 
 
 
202 aa  165  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
201 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  37.07 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  40.95 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  35.14 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  32.73 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  28.99 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  32.17 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  33.02 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  38.04 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  33.96 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  35.65 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  35.24 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.73 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  25.54 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
220 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3700  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
167 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438401  normal  0.207291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  29.91 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
179 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
206 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  27.86 
 
 
263 aa  61.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 
206 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  27.62 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  29.58 
 
 
246 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  25.74 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  28.69 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  27.54 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  26.09 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  34.62 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 
206 aa  58.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  30.82 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  24.46 
 
 
214 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>