222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2612 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 
246 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  45.19 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  31.12 
 
 
239 aa  149  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  35.53 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  30.09 
 
 
224 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.82 
 
 
540 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.74 
 
 
562 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.47 
 
 
344 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  29.22 
 
 
181 aa  89  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  31.22 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.62 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
182 aa  82  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  39.42 
 
 
178 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  40.59 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13637  Multimeric flavodoxin WrbA  29.38 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  37.76 
 
 
200 aa  72  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1044  hypothetical protein  27.33 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  32.5 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  28.74 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  32.71 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 
189 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
180 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 
193 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  25.86 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  33 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0062  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
435 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  36 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  37.11 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  31.53 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  31.48 
 
 
185 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
183 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
191 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0045  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
431 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
217 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 
191 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
217 aa  62.4  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
190 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  32.11 
 
 
187 aa  62.4  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
208 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
190 aa  62  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
205 aa  62  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  33.96 
 
 
193 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1840  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  30.4 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
190 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  29.31 
 
 
189 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  29.58 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
190 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>