More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1510 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1510  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
202 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  55.1 
 
 
202 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2465  NADPH-dependent FMN reductase  53.54 
 
 
202 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0489  NADPH-dependent FMN reductase  56.63 
 
 
206 aa  222  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  49.49 
 
 
199 aa  218  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0621  NADPH-dependent FMN reductase  57.14 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.295503  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  47.87 
 
 
195 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  46.63 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  44.04 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  44.04 
 
 
194 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  45.08 
 
 
193 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  41.15 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
195 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
187 aa  109  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  36.32 
 
 
193 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  37.75 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  34.42 
 
 
197 aa  87.8  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  37.01 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  39.13 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
212 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  35.06 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  34.42 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  32.9 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.9 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.46 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  37.61 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  35.85 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  41.03 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  29.85 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  30.26 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  29.47 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  29.38 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  31.88 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  29.1 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  27.66 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.32 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  30.2 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  35 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  32.79 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.61 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  32.08 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  25.25 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  31.01 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  36.71 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  29.77 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.62 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  31.01 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  36.96 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  27.13 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  38.39 
 
 
159 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  28.66 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
190 aa  61.2  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 
217 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  32.56 
 
 
199 aa  61.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
190 aa  61.2  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  31.97 
 
 
212 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  26.34 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  31.58 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  27.69 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  30.82 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  25.41 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  31.09 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  30.4 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  29.56 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  35.53 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  35.53 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  34.13 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>