More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2465 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2465  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  54.23 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1510  NADPH-dependent FMN reductase  53.54 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  51.85 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0489  NADPH-dependent FMN reductase  55.05 
 
 		 206 aa  221  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  46.46 
 
 		 199 aa  208  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0621  NADPH-dependent FMN reductase  55.5 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.295503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  41.75 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  43.3 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  43.3 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  42.78 
 
 		 193 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  41.24 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  38.22 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  33.5 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.83 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  29.06 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  43.04 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  40.68 
 
 		 168 aa  72  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  34.04 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  31.09 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  33.33 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  31.61 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  40.51 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  31.98 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  34.26 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  41.59 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  31.09 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  31.09 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  33.86 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  29.5 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.16 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  33.51 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  37.01 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  34.09 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  34.09 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  30.73 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.47 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  31.63 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  42.16 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  36.19 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  42.16 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  29.59 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  32.26 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  34.21 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  31.58 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  26.56 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  28.42 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.21 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  30.88 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.71 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  38.28 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  34.29 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  30.57 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  32.81 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  32.29 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>