276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1266 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.46 
 
 		 540 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 562 aa  1168    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.12 
 
 		 344 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  28.63 
 
 		 250 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  27.2 
 
 		 239 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  30.74 
 
 		 246 aa  101  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 		 224 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  27.04 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  35.24 
 
 		 183 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  26.4 
 
 		 183 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  27.27 
 
 		 181 aa  67  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  30.23 
 
 		 209 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 204 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  36.19 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0062  NADPH-dependent FMN reductase  28.03 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 202 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  27.11 
 
 		 173 aa  65.1  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  30.28 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  33.02 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 		 220 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 		 185 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0045  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 431 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 		 180 aa  62  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 191 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 		 209 aa  62  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1044  hypothetical protein  28.71 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  26.85 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  27.95 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0759  NADPH-dependent FMN reductase  32.1 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 211 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 		 211 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 		 191 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 		 186 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 		 211 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 		 224 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 		 192 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 		 220 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 179 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 236 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13637  Multimeric flavodoxin WrbA  28.24 
 
 		 191 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 		 186 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  28.97 
 
 		 198 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  26.17 
 
 		 199 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 		 172 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  30.84 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  28.97 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 		 211 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 193 aa  57  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  29.36 
 
 		 191 aa  56.6  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 		 193 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 187 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1108  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 		 252 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  29.01 
 
 		 193 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 		 193 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  29.25 
 
 		 187 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 		 193 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  28.03 
 
 		 208 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 178 aa  55.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 		 190 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 		 209 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 191 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 		 193 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 		 190 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 		 224 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 		 192 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 218 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  27.15 
 
 		 185 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.56 
 
 		 321 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  29.32 
 
 		 212 aa  54.7  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.36 
 
 		 256 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 206 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 179 aa  54.3  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>