58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1044 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1044  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  348  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2132  hypothetical protein  35.67 
 
 
166 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13637  Multimeric flavodoxin WrbA  37.8 
 
 
191 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0045  NADPH-dependent FMN reductase  38.4 
 
 
431 aa  91.7  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  33.33 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0062  NADPH-dependent FMN reductase  35.57 
 
 
435 aa  88.2  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0759  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
436 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1065  hypothetical protein  35.76 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  27.33 
 
 
246 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0994  hypothetical protein  35.44 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.92 
 
 
540 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1840  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  37.68 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
562 aa  61.2  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.13 
 
 
344 aa  60.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  31.01 
 
 
250 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  32.88 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  24.37 
 
 
263 aa  52  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  36.62 
 
 
208 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  33.82 
 
 
191 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 
217 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
214 aa  47.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0094  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
225 aa  47.4  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  32.95 
 
 
222 aa  47.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04910  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
189 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.799162  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2647  NADPH-dependent FMN reductase  27.35 
 
 
209 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475353  normal  0.334507 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3700  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438401  normal  0.207291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
214 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  25 
 
 
179 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  30.68 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  36.51 
 
 
212 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
223 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
217 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  31.17 
 
 
205 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
193 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
193 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  31.17 
 
 
194 aa  44.7  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
206 aa  44.3  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  26.25 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 
217 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  27.54 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  25.19 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
217 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  25.18 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  30.49 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
222 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  28.36 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 
224 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00760  hypothetical protein  26.77 
 
 
211 aa  41.6  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  28.36 
 
 
192 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
190 aa  40.8  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  37.68 
 
 
212 aa  40.8  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>