152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1523 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1523  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
284 aa  590  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0022  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  33.58 
 
 
282 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2546  multimeric flavodoxin WrbA-like  31.6 
 
 
287 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.597864  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2499  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  38.78 
 
 
116 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  35 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2158  multimeric flavodoxin WrbA fused to cytochrome c- like domain  24.22 
 
 
316 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.322969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  28.7 
 
 
187 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
206 aa  62.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
193 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  62.4  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
193 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
194 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
193 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  26.26 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
204 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  27.05 
 
 
206 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 
263 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 
191 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  36.78 
 
 
185 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
184 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  29 
 
 
200 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.08 
 
 
540 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
212 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 
202 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
194 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  33.05 
 
 
180 aa  55.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
208 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  30.88 
 
 
193 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  22.07 
 
 
311 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.68 
 
 
193 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 
208 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
182 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  26.95 
 
 
182 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  27.91 
 
 
189 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  26.39 
 
 
208 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  28.36 
 
 
220 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  29 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  30.3 
 
 
185 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
204 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
189 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  29.06 
 
 
193 aa  53.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
179 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  28.57 
 
 
222 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  23.74 
 
 
183 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  30.93 
 
 
195 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 
199 aa  52.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
208 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 
187 aa  52.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
209 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  26.42 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
177 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  25.25 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 
208 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  28.85 
 
 
183 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  25.58 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  26.13 
 
 
185 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 
222 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 
190 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
190 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
184 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  28.71 
 
 
192 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  28.16 
 
 
178 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
204 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 
218 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  25.56 
 
 
187 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  30.09 
 
 
197 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  25.27 
 
 
182 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 
223 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 
222 aa  49.3  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  26.17 
 
 
224 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3676  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  26.26 
 
 
186 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1108  NADPH-dependent FMN reductase  27.41 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
214 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0094  NADPH-dependent FMN reductase  24.14 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3700  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 
167 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438401  normal  0.207291 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3724  NADPH-dependent FMN reductase  27.36 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  25.82 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
216 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  30.34 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
206 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
224 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 
179 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.67 
 
 
344 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  29.59 
 
 
197 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>