197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0022 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0022  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  100 
 
 
282 aa  584  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2499  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  78.9 
 
 
116 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1523  NADPH-dependent FMN reductase  33.58 
 
 
284 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2546  multimeric flavodoxin WrbA-like  33.21 
 
 
287 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.597864  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
193 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
193 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
193 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
188 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  42.42 
 
 
194 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  24.9 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
184 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  38.24 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
184 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  30.54 
 
 
185 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  38.61 
 
 
192 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2158  multimeric flavodoxin WrbA fused to cytochrome c- like domain  22.36 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.322969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  33.94 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2647  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475353  normal  0.334507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  27.5 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
190 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  29.26 
 
 
185 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 
183 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
190 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
190 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
186 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
194 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  35.77 
 
 
189 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
194 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
217 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  25.28 
 
 
186 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  31.93 
 
 
195 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  29.11 
 
 
187 aa  62.4  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
206 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3724  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
213 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
204 aa  62.4  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
178 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  26.04 
 
 
211 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  38.82 
 
 
208 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  26.04 
 
 
211 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
179 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  35.16 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 
195 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
191 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  30.5 
 
 
211 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
208 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  24.72 
 
 
186 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  38.61 
 
 
194 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
218 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
206 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 
192 aa  59.7  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 
211 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
217 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  30.47 
 
 
223 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
189 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  36.17 
 
 
207 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
204 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  35.05 
 
 
195 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
192 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  28.04 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
190 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  31.03 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 
191 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
188 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
205 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 
190 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
220 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
198 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  29.7 
 
 
178 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
180 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
208 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
217 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
216 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
191 aa  55.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
224 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
216 aa  55.8  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  28.15 
 
 
203 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0094  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  27.22 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
214 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>