149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2546 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2546  multimeric flavodoxin WrbA-like  100 
 
 
287 aa  585  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.597864  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0022  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  33.21 
 
 
282 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1523  NADPH-dependent FMN reductase  31.6 
 
 
284 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
182 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  29.85 
 
 
186 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  27.61 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  29.69 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
220 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  29.83 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
206 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
191 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
204 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
188 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  32.23 
 
 
187 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
184 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
185 aa  62.4  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  30.91 
 
 
178 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
193 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 
194 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
202 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  27.57 
 
 
185 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  29.69 
 
 
207 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2158  multimeric flavodoxin WrbA fused to cytochrome c- like domain  27.52 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.322969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 
207 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
189 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  27.61 
 
 
186 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
193 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  26.11 
 
 
192 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  30.69 
 
 
200 aa  59.3  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
193 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  32 
 
 
194 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  26.77 
 
 
185 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
189 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  32.63 
 
 
179 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
178 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  28.88 
 
 
179 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
184 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 
194 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
195 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  25.86 
 
 
194 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  26.99 
 
 
195 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
221 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  30.58 
 
 
192 aa  56.6  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
190 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
210 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
208 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
182 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
208 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  29.46 
 
 
204 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 
179 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
197 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  26.89 
 
 
191 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 
190 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  25.49 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  26.89 
 
 
208 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  32.69 
 
 
183 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
194 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
203 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
191 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
193 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
199 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
199 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
220 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
204 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
211 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  26.34 
 
 
190 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  32.29 
 
 
191 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
179 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
186 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
192 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  32.54 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
192 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  26.57 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  26.72 
 
 
191 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  30.17 
 
 
206 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  31 
 
 
191 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 
200 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
189 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  28.33 
 
 
198 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
193 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  27.05 
 
 
193 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  25.45 
 
 
211 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2499  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  34.33 
 
 
116 aa  48.9  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  31 
 
 
201 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>