159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2499 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2499  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  100 
 
 
116 aa  239  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0022  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  78.9 
 
 
282 aa  177  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1523  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  51.52 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  47.06 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  46.48 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  46.48 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 
193 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
185 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
188 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
311 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
204 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  39.06 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  43.06 
 
 
217 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 
216 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  29.9 
 
 
216 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  44.44 
 
 
194 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 
224 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  31.68 
 
 
212 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 
208 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  46.43 
 
 
192 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
228 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  35.9 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
217 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  40.28 
 
 
214 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  41.89 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  32.22 
 
 
211 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
239 aa  52  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  39.19 
 
 
192 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  45 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  37.68 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
211 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  34.18 
 
 
218 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  28.97 
 
 
206 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  32.47 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 
204 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 
270 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 
179 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3724  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
213 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  40.91 
 
 
195 aa  51.2  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  37.88 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  41.51 
 
 
248 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
217 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
205 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
221 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  41.18 
 
 
207 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 
211 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
216 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
214 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
217 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
185 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2647  NADPH-dependent FMN reductase  38.96 
 
 
209 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475353  normal  0.334507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  37.88 
 
 
207 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
194 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  32.84 
 
 
194 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  35.53 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  41.1 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 
562 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  36.23 
 
 
220 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2546  multimeric flavodoxin WrbA-like  34.33 
 
 
287 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.597864  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  34.62 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  26.55 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  35.62 
 
 
198 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0094  NADPH-dependent FMN reductase  36.23 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  37.68 
 
 
220 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  34.67 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  34.94 
 
 
199 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  37.14 
 
 
211 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  39.06 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04910  NADPH-dependent FMN reductase  40.3 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.799162  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  41.51 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  34.94 
 
 
199 aa  47.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  25.23 
 
 
211 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
179 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 
191 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  38.36 
 
 
220 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
208 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  31.37 
 
 
178 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
190 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  29.33 
 
 
191 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  33.78 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
263 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 
207 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
236 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.88 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  34.67 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 
197 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
223 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  33.82 
 
 
262 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  32.88 
 
 
216 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>