67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1746 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1746  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  490  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1737  hypothetical protein  68.1 
 
 
234 aa  346  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1736  hypothetical protein  63.25 
 
 
234 aa  331  5e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.583846  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1865  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0192  NADPH-dependent FMN reductase  35.06 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  28.03 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  29.49 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  22.32 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  28.95 
 
 
178 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
179 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 
540 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  22.95 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  26.52 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 
180 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  30.93 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  26.96 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  25.97 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  25.76 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  25.19 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
190 aa  48.9  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  25.19 
 
 
195 aa  48.5  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  26.73 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  26.72 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1108  NADPH-dependent FMN reductase  22.92 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  25.83 
 
 
221 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
197 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 
206 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  23.02 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  24.26 
 
 
263 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
220 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
225 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  29 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  27.72 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  27.21 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  25.19 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  25.19 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.71 
 
 
562 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  25.49 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  25.2 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  26.36 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  26.79 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  23.68 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
179 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  26.77 
 
 
197 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  25.17 
 
 
186 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  28 
 
 
185 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  22.22 
 
 
217 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  25.4 
 
 
200 aa  42  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  24.35 
 
 
214 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
182 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  28.86 
 
 
193 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  27.54 
 
 
216 aa  41.6  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>