144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1865 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1865  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 224 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1736  hypothetical protein  38.16 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.583846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1737  hypothetical protein  36.4 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1746  hypothetical protein  33.77 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0192  NADPH-dependent FMN reductase  29.48 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  25.73 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  26.46 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  26.46 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  24.47 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  24.15 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1108  NADPH-dependent FMN reductase  25.53 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  25.64 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  25.71 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  28.18 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  29.33 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  24.21 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  24.21 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2647  NADPH-dependent FMN reductase  26.71 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475353  normal  0.334507 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  18.8 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  28.03 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  29.7 
 
 		 181 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  23.78 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  25.44 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  24.59 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  28.67 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  26.43 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  27.06 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  27.46 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  28.07 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 178 aa  48.9  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  24.56 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  22.22 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  26.5 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  25.44 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  21.85 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  25.21 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  29.47 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  25.58 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  31.46 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  24.83 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  26.05 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.85 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  27.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  27.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  27.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  27.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  27.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  26.17 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  23.76 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  25.93 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  24.14 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.27 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  24.79 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  26.45 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  26.36 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  27.62 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  25.56 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.24 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  22.31 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  26.13 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  26.13 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  26.13 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  26.13 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  26.13 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  26.36 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  24.38 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  25.17 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  32.73 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>