176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3414 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
186 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  43.55 
 
 
210 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2184  iron-sulfur flavoprotein, putative  42.7 
 
 
201 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0986799  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  42.17 
 
 
204 aa  121  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0785  iron-sulfur flavoprotein, putative  42.54 
 
 
207 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0958732  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1732  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
231 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00073887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.84 
 
 
321 aa  86.3  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
201 aa  84.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  29.88 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  30.41 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  39.58 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  27.57 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  31.64 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  22.6 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  30.97 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  24.71 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
179 aa  61.2  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 
197 aa  60.8  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
203 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  24.19 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  24.31 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  28.29 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 
186 aa  58.2  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 
202 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  32.95 
 
 
189 aa  57.8  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
211 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  23.78 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  28.47 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  31.08 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
205 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  24.73 
 
 
209 aa  55.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  28.4 
 
 
212 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  25.15 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 
211 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  24.84 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.42 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  28.78 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  36.73 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  29 
 
 
195 aa  54.7  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
193 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5295  FMN reductase, NADPH-dependent  26.85 
 
 
181 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 
186 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5027  FMN reductase, NADPH-dependent  26.85 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5408  FMN reductase, NADPH-dependent  26.85 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516964  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  26.84 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  23.37 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5265  FMN reductase, NADPH-dependent  26.85 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  30.2 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5340  FMN reductase, NADPH-dependent  25.5 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5662  FMN reductase, NADPH-dependent  26.17 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  27.14 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4857  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  26.17 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 
208 aa  52  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  24.73 
 
 
182 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5282  FMN reductase, NADPH-dependent  26.17 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
180 aa  51.6  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07470  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 
192 aa  51.2  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  32.21 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4872  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  25.5 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  30.53 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  41.94 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  23.44 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  26.85 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  35.58 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  26.57 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  27.83 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>