118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1732 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1732  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00073887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  41.45 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0785  iron-sulfur flavoprotein, putative  41.29 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0958732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  39.38 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2184  iron-sulfur flavoprotein, putative  36.47 
 
 
201 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0986799  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
186 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 
201 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.89 
 
 
321 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  28.07 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.99 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  30.18 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  27.23 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  23.86 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  23.76 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  27.88 
 
 
186 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  24.04 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  28.03 
 
 
183 aa  62  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  29.52 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  25.38 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  24.28 
 
 
191 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.17 
 
 
193 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  24.24 
 
 
179 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07470  NADPH-dependent FMN reductase  29.6 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 
188 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  24.63 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  28.75 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 
189 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  21.29 
 
 
199 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  25.54 
 
 
212 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  28.37 
 
 
197 aa  55.1  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  24.14 
 
 
178 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  29.32 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  27.35 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  25.79 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 
190 aa  52.4  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  26.17 
 
 
211 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
190 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  27.44 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.3 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  28.57 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  25.71 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  26.47 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  26.47 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
193 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  27.1 
 
 
193 aa  49.7  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  28.04 
 
 
173 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 
185 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 
193 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  29.69 
 
 
207 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
193 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  28.23 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  24.76 
 
 
182 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  26.71 
 
 
201 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  25.64 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  26.71 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  19.9 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  24.14 
 
 
182 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  22.41 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  23.78 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  26.17 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  24.04 
 
 
182 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 
180 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
204 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  24.78 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  28.33 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  26.13 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
221 aa  45.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.06 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 
207 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  29.57 
 
 
191 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  25.89 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  23.65 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
294 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.53 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  24.76 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  24.64 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  23.85 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  25.6 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  26.81 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  26.89 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>