169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2856 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  58.59 
 
 		 204 aa  235  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0785  iron-sulfur flavoprotein, putative  54.08 
 
 		 207 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0958732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  43.55 
 
 		 186 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1732  NADPH-dependent FMN reductase  41.45 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00073887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2184  iron-sulfur flavoprotein, putative  39.39 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0986799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 		 201 aa  91.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.43 
 
 		 321 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  26.29 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  30.41 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  24.37 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  24.26 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 		 294 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  23.04 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  23.12 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  25.39 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  25.64 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  27.12 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  25.53 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  28.82 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  30.24 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  25.75 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  26.11 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  25.48 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  26.76 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  35.71 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  26.75 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  32.35 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  34 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  26.26 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  21.47 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  25.26 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  26.73 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  26.73 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  25.43 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  28.45 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  27.15 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  30.5 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  24.17 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  23.94 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  28.06 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  27.22 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  23.81 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  31.25 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  25.34 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  28.3 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  22.1 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  25.25 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  20.97 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  28.06 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  31 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  25.25 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.88 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  27.11 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  27 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07470  NADPH-dependent FMN reductase  26.86 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  27 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  25.21 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  28.42 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  26.62 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  21.32 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>