203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0542 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  100 
 
 
204 aa  416  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  58.59 
 
 
210 aa  235  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0785  iron-sulfur flavoprotein, putative  49.25 
 
 
207 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0958732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2184  iron-sulfur flavoprotein, putative  40.96 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0986799  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  42.17 
 
 
186 aa  121  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1732  NADPH-dependent FMN reductase  39.38 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00073887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  27.51 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  25.93 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.8 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  37.86 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  30.06 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  25.53 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  27.75 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  25.93 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  35.79 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  32.77 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1845  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 
152 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  28.97 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  26.71 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  30.36 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  30.69 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  26 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  32 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
194 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  24.37 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  28.04 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  27.82 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
177 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  30.61 
 
 
178 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  24.71 
 
 
191 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4971  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.72 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  29.29 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  29.6 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  27.36 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  28.46 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  23.71 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  25.51 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
294 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  28.04 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  26.92 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5027  FMN reductase, NADPH-dependent  26.52 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5265  FMN reductase, NADPH-dependent  26.52 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  26.26 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5408  FMN reductase, NADPH-dependent  26.52 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  26.26 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
186 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
195 aa  52  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
186 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5662  FMN reductase, NADPH-dependent  28.12 
 
 
181 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4857  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  27.27 
 
 
181 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
224 aa  51.6  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  30.1 
 
 
182 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>