54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0759 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0759  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
436 aa  906    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0045  NADPH-dependent FMN reductase  45.71 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0062  NADPH-dependent FMN reductase  45.71 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13637  Multimeric flavodoxin WrbA  38.5 
 
 
191 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  30.41 
 
 
181 aa  92.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13630  Multimeric flavodoxin WrbA  33.88 
 
 
123 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  31.79 
 
 
250 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1044  hypothetical protein  32.43 
 
 
170 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13635  Multimeric flavodoxin WrbA  43.04 
 
 
87 aa  81.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2132  hypothetical protein  29.75 
 
 
166 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1841  hypothetical protein  26.71 
 
 
218 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0994  hypothetical protein  36.67 
 
 
94 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13650  NADPH-dependent FMN reductase  45.31 
 
 
70 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0780061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.71 
 
 
540 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
239 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 
224 aa  63.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1065  hypothetical protein  34.52 
 
 
162 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1045  hypothetical protein  24.64 
 
 
200 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.495182  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.1 
 
 
562 aa  60.5  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1840  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  38.27 
 
 
179 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2133  hypothetical protein  27.1 
 
 
213 aa  60.1  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  27.04 
 
 
246 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  27.88 
 
 
187 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
190 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0781  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  21.49 
 
 
220 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  24.64 
 
 
225 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 
222 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  33.8 
 
 
204 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  27 
 
 
177 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
199 aa  47.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1064  hypothetical protein  26.67 
 
 
211 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 
190 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  22.52 
 
 
208 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  27 
 
 
173 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  35.63 
 
 
201 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
190 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
217 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  21.57 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  24.63 
 
 
205 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  24.79 
 
 
222 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  40.62 
 
 
185 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 
194 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  23.13 
 
 
194 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  29.9 
 
 
172 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  29.58 
 
 
207 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1426  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.5 
 
 
224 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.681174  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  31.25 
 
 
212 aa  43.9  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
193 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  27.46 
 
 
222 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 
218 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  21.2 
 
 
222 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
193 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  31.73 
 
 
193 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>