20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1065 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1065  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  333  7e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2132  hypothetical protein  49.39 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0994  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1044  hypothetical protein  35.76 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13637  Multimeric flavodoxin WrbA  34.71 
 
 		 191 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0045  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 431 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  34.91 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0062  NADPH-dependent FMN reductase  35.63 
 
 		 435 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0759  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 		 436 aa  62.4  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 		 239 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.82 
 
 		 344 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  27.27 
 
 		 246 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.25 
 
 		 540 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  29.89 
 
 		 250 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.52 
 
 		 562 aa  43.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 		 184 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  32.89 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  26.47 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>