126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1840 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1840  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0045  NADPH-dependent FMN reductase  25.6 
 
 
431 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1044  hypothetical protein  37.68 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  30.4 
 
 
246 aa  61.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0062  NADPH-dependent FMN reductase  26.57 
 
 
435 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0759  NADPH-dependent FMN reductase  38.27 
 
 
436 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  31.4 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13637  Multimeric flavodoxin WrbA  26.4 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  35.79 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  29.41 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
190 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  29.21 
 
 
250 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  20.25 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
224 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
190 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 
193 aa  52.4  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  25.25 
 
 
204 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  27.22 
 
 
179 aa  52  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  32.1 
 
 
228 aa  52  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
262 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
190 aa  50.8  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  35.62 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  26.97 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  23.91 
 
 
239 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  29.49 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  21.05 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  32.1 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  32.1 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  30.23 
 
 
248 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  28.4 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.75 
 
 
224 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  31.17 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  32.91 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  48.9  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  28.41 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  31.4 
 
 
222 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
220 aa  48.5  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
185 aa  48.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
311 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  26.73 
 
 
182 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  23.81 
 
 
194 aa  48.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 
208 aa  48.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
200 aa  48.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 
197 aa  47.8  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.87 
 
 
256 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  22.34 
 
 
263 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  27.16 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  25.44 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
222 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  37.1 
 
 
208 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  23.78 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.27 
 
 
321 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  26.14 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3700  NADPH-dependent FMN reductase  27.12 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438401  normal  0.207291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  26.25 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3676  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
227 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
225 aa  45.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  33.82 
 
 
216 aa  45.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  27.5 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  23.81 
 
 
194 aa  44.7  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 
195 aa  45.1  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.27 
 
 
540 aa  44.7  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  22.29 
 
 
204 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
211 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
220 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  29.49 
 
 
222 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  26.97 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  25.84 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  26.85 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  30.99 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  23.16 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  25.86 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  30.26 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  26.04 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0022  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  34.43 
 
 
282 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  28.38 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  27.56 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>