More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1426 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1426  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.681174  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  77.83 
 
 
227 aa  349  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.042412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.52 
 
 
207 aa  184  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.06 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.71 
 
 
207 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.84 
 
 
202 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  33.17 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.17 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.17 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 
199 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.17 
 
 
199 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 
199 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 
204 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 
202 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.97 
 
 
198 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.03 
 
 
205 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.17 
 
 
202 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 
198 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.97 
 
 
198 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.97 
 
 
198 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.18 
 
 
202 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.26 
 
 
208 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.26 
 
 
208 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.62 
 
 
233 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.54 
 
 
239 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.84 
 
 
198 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.35 
 
 
198 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.35 
 
 
198 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.97 
 
 
198 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.35 
 
 
237 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.35 
 
 
237 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.35 
 
 
237 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.35 
 
 
237 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.35 
 
 
237 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.22 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.79 
 
 
198 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  31.64 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 
198 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.43 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.17 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.76 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.48 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2463  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.36 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.14 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.68 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  35.16 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.73 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.69 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.09 
 
 
192 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.24 
 
 
211 aa  95.5  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  34.22 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0529615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  33.69 
 
 
203 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  33.16 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  33.16 
 
 
203 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  32.26 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  31.18 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 
204 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.77 
 
 
202 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.34 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.83 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.6 
 
 
223 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.84 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.78 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  31.47 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.78 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.15 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.34 
 
 
193 aa  92.8  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.09 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
203 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
210 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.24 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  31.75 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.24 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  31.4 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.69 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  31.4 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.85 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.75 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.4 
 
 
201 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  32.34 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.99 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  31.4 
 
 
201 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  31.4 
 
 
201 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  31.4 
 
 
201 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
198 aa  89  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.92 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  30.92 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  30.92 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.78 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>