More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2018 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.042412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1426  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  77.83 
 
 		 224 aa  349  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.681174  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.28 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.83 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  34.48 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.37 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.67 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.37 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.81 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  36.84 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.54 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.51 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.08 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.53 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.7 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  40 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.46 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.84 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.84 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.98 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.65 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.65 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.84 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.38 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.68 
 
 		 202 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.84 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.84 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.84 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.84 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.54 
 
 		 199 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.46 
 
 		 198 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.46 
 
 		 198 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.46 
 
 		 198 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 		 199 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.33 
 
 		 198 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.56 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.56 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  30.86 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 		 191 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 		 199 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.28 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2463  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.9 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  30.88 
 
 		 197 aa  95.5  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.04 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.22 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.02 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.73 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.22 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  30.73 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  31.22 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  32.96 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0529615 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  31.22 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.34 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  30.73 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.91 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  30.73 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  30.73 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.75 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31 
 
 		 212 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.07 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.11 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.89 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.09 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 		 204 aa  92  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  31.84 
 
 		 202 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.79 
 
 		 203 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.5 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.89 
 
 		 198 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.89 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  30.24 
 
 		 201 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.42 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  31.89 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.31 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  30.88 
 
 		 194 aa  88.6  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.49 
 
 		 197 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  32.43 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.47 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.74 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.74 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.14 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.89 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  34.03 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.85 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  30.24 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.01 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.01 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  34.03 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  34.55 
 
 		 203 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  30.24 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>