More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1679 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.91 
 
 
191 aa  206  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  53.89 
 
 
202 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.31 
 
 
199 aa  194  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.88 
 
 
193 aa  186  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  45.26 
 
 
216 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46.02 
 
 
198 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.4 
 
 
198 aa  158  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.86 
 
 
237 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.86 
 
 
237 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.86 
 
 
237 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.86 
 
 
237 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.86 
 
 
198 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.86 
 
 
198 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.86 
 
 
237 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.25 
 
 
198 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.25 
 
 
198 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.25 
 
 
198 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.39 
 
 
198 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  42.54 
 
 
196 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.62 
 
 
199 aa  151  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.1 
 
 
198 aa  150  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  41.33 
 
 
198 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.83 
 
 
196 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  39.59 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3728  putative acyl carrier protein phosphodiesterase  40.24 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.64 
 
 
207 aa  144  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.23 
 
 
198 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.8 
 
 
198 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.8 
 
 
198 aa  141  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  36.41 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.51 
 
 
199 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.29 
 
 
213 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.71 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0354  FMN-dependent NADH-azoreductase 1  53.98 
 
 
214 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.65 
 
 
207 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.88 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.34 
 
 
202 aa  130  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.93 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.27 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.46 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  40 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
203 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  39.43 
 
 
201 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.42 
 
 
211 aa  118  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  36.84 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.82 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.86 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  38.86 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  36.52 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  37.5 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.87 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.38 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.64 
 
 
201 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.42 
 
 
197 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  38.64 
 
 
201 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  36.53 
 
 
213 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.14 
 
 
202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.69 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.69 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.59 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  35.05 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  36.41 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2923  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.21 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660673  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  35.48 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  36.02 
 
 
201 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  40.24 
 
 
198 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  40.24 
 
 
198 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4167  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  37.02 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.61 
 
 
208 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.61 
 
 
208 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  38.67 
 
 
208 aa  111  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  36.41 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  38.46 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  36.57 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  34.81 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.55 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>