286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1165 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
213 aa  418  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.39 
 
 
207 aa  157  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.29 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.79 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.83 
 
 
233 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.46 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.04 
 
 
208 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  30.45 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.49 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.38 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.84 
 
 
238 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  37.78 
 
 
210 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.89 
 
 
204 aa  118  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3715  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.336776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.22 
 
 
199 aa  111  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.11 
 
 
199 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.07 
 
 
212 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.37 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  35.78 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  39.23 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.5 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 
197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.44 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.55 
 
 
229 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  38.12 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.3 
 
 
229 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  36.11 
 
 
199 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.61 
 
 
212 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.12 
 
 
201 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3728  putative acyl carrier protein phosphodiesterase  38.89 
 
 
196 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  38.12 
 
 
201 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.67 
 
 
214 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  38.12 
 
 
201 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  38.12 
 
 
201 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  38.12 
 
 
201 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.67 
 
 
214 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.98 
 
 
202 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
199 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.12 
 
 
201 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  37.57 
 
 
201 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  38.12 
 
 
201 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
202 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.84 
 
 
193 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.7 
 
 
207 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  31.55 
 
 
211 aa  104  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.63 
 
 
212 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.89 
 
 
232 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.89 
 
 
232 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.7 
 
 
215 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.81 
 
 
199 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  37.16 
 
 
201 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 
204 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  38.8 
 
 
201 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  38.8 
 
 
201 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  38.8 
 
 
201 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  38.8 
 
 
201 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  38.8 
 
 
201 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  38.25 
 
 
201 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  38.25 
 
 
201 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  38.25 
 
 
201 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  35 
 
 
213 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  37.02 
 
 
201 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.7 
 
 
217 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.16 
 
 
199 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.78 
 
 
198 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.48 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.48 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.48 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.48 
 
 
198 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.48 
 
 
198 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.97 
 
 
232 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.38 
 
 
232 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.48 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.48 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  35 
 
 
213 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.22 
 
 
198 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.88 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.81 
 
 
191 aa  98.6  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  36.46 
 
 
201 aa  97.8  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.71 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.88 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.24 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.02 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.02 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.02 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  36.46 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.24 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  40.11 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2463  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.26 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  37.5 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  39.56 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.99 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.36 
 
 
198 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.26 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  39.56 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.5 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  36.07 
 
 
201 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>