More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6977 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  96.12 
 
 		 232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  96.12 
 
 		 232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  72.43 
 
 		 214 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  72.43 
 
 		 214 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.49 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60 
 
 		 207 aa  261  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.19 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  59.22 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.1 
 
 		 208 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.1 
 
 		 208 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  62.03 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  56.76 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  54.35 
 
 		 216 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.14 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.5 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.59 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  55.56 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  54.59 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50.75 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.91 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.91 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  49.51 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.91 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.5 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.97 
 
 		 203 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.03 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  55.06 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  55.06 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.91 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.25 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  47.06 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  50 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  48.94 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  48.68 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  49.21 
 
 		 203 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.21 
 
 		 201 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.66 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  48.15 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  48.17 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  47.34 
 
 		 202 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.61 
 
 		 202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.56 
 
 		 203 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  44.12 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.03 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.77 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.08 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.63 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.94 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.27 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.9 
 
 		 199 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40 
 
 		 199 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.5 
 
 		 182 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  40.5 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  42.16 
 
 		 201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  42.16 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  42.16 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.6 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.26 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  41.67 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  41.67 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  41.67 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  43.14 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.14 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  41.67 
 
 		 201 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  41.67 
 
 		 201 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  42.08 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  42.08 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  42.08 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.5 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  41.38 
 
 		 201 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.6 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  40.89 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.61 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  43.32 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  43.32 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  43.32 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  43.32 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  43.32 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.72 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.62 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  41.67 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  41.09 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.62 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.24 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  40.98 
 
 		 197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  42.16 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  41.58 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  41.63 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  41.58 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  41.58 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.39 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  41.58 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  42.16 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  41.58 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>