More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1540 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  81.11 
 
 		 216 aa  348  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71.63 
 
 		 215 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71.58 
 
 		 216 aa  280  9e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  67.68 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  71.04 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.82 
 
 		 212 aa  267  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  67.93 
 
 		 203 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  57.14 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  57.14 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.64 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.64 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  55.28 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  55.28 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.95 
 
 		 202 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  60.11 
 
 		 208 aa  214  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.27 
 
 		 232 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  51.44 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  55.19 
 
 		 201 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  56.45 
 
 		 202 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.2 
 
 		 206 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.28 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.25 
 
 		 207 aa  201  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.74 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.52 
 
 		 207 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.97 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.97 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  53.48 
 
 		 202 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  49.75 
 
 		 202 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  51.26 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.96 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  52.43 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.18 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  50.81 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  51.35 
 
 		 203 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.25 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.52 
 
 		 195 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  50.81 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  50.8 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  49.73 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.55 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  52.49 
 
 		 198 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  52.49 
 
 		 198 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  49.27 
 
 		 199 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  50 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.25 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.26 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.5 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.2 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.13 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.19 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.06 
 
 		 203 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.88 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.55 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.55 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.57 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.57 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.88 
 
 		 182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.57 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.55 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.11 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.9 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  43.48 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  43.48 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  43.48 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  45.95 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  45.95 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  45.95 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  45.95 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  45.95 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.66 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.78 
 
 		 201 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  44.78 
 
 		 201 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  42 
 
 		 201 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.31 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  43.35 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.28 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  44.28 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  44.28 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  44.28 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  44.28 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  42.03 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  44.28 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  43.78 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.81 
 
 		 198 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  43.84 
 
 		 201 aa  147  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  40.58 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  43.94 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.16 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  43.28 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.79 
 
 		 199 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.13 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.13 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.13 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.4 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  42.42 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  43.07 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  42.79 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  42.42 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>