289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3160 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.13 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  47.73 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.73 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.85 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  37.27 
 
 		 219 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.27 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3715  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.46 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.336776 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.42 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.76 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.32 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.53 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  45.13 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.55 
 
 		 199 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.35 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.83 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.03 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.96 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  37.09 
 
 		 199 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.5 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.56 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.84 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.84 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.67 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.3 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.24 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.69 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.69 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.5 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.49 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.03 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  33.03 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.23 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  33.03 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.29 
 
 		 204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  33.03 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  33.03 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.57 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  32.57 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  32.57 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  32.57 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.58 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  36.76 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  34.4 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.84 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.53 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  34.4 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  34.4 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  34.4 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  34.4 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.94 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.94 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  32.11 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 		 199 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  33.33 
 
 		 201 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.87 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1426  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.62 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.681174  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  34.02 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.86 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  29.95 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.36 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.36 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  34.22 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  35.68 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.84 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  35.68 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  35.68 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  29.03 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.7 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.7 
 
 		 198 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.7 
 
 		 198 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.7 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.7 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.7 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.7 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.75 
 
 		 198 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.18 
 
 		 202 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  31.92 
 
 		 202 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  34 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  32.99 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.49 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  31.22 
 
 		 201 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.32 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  30.57 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.28 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.042412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 		 198 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.32 
 
 		 198 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.27 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>