277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5707 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
221 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  53.88 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50.92 
 
 
229 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.92 
 
 
229 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3715  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.75 
 
 
227 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.336776 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.2 
 
 
222 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.32 
 
 
236 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.91 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.73 
 
 
233 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.82 
 
 
239 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  41.29 
 
 
212 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.45 
 
 
205 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 
207 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.81 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.81 
 
 
212 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.49 
 
 
213 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.39 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 
197 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.67 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.67 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.87 
 
 
208 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  39.73 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.33 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.02 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.11 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.89 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.08 
 
 
217 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.86 
 
 
202 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
199 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
204 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
209 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.15 
 
 
203 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 
208 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 
208 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.66 
 
 
210 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
199 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.82 
 
 
193 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
199 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
199 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
207 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 
216 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30 
 
 
199 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.08 
 
 
191 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.48 
 
 
216 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  33.71 
 
 
202 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3049  azoreductase type 1 family protein  31.73 
 
 
209 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.053598  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  28.92 
 
 
199 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.66 
 
 
202 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  30.29 
 
 
201 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.08 
 
 
223 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.42 
 
 
182 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.3 
 
 
204 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.45 
 
 
203 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  32.49 
 
 
203 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  30.19 
 
 
201 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.32 
 
 
232 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.85 
 
 
214 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.32 
 
 
232 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.85 
 
 
214 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.58 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.87 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.69 
 
 
203 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  29.31 
 
 
211 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.24 
 
 
215 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  32.55 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.52 
 
 
206 aa  98.6  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.46 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
199 aa  98.2  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  35.62 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.14 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  35.8 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.16 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.5 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  31.25 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  35.62 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.69 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  41.53 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  35.62 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  35.62 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.98 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  30.14 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  34.29 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.81 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  30 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.67 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  41.53 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  41.53 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  30.14 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.14 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  30.14 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  30.14 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  30.14 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  30.14 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  36.3 
 
 
201 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.38 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  36.3 
 
 
201 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>