296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2972 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3715  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  65.6 
 
 
227 aa  300  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.336776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  59.42 
 
 
229 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.42 
 
 
229 aa  268  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.88 
 
 
221 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.85 
 
 
222 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.18 
 
 
236 aa  185  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.37 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.27 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.82 
 
 
239 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.45 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.64 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.09 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
197 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.91 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.39 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.22 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
199 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.56 
 
 
202 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.37 
 
 
199 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.82 
 
 
212 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.27 
 
 
205 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.91 
 
 
207 aa  104  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  38.56 
 
 
210 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  28.64 
 
 
199 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.25 
 
 
199 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.14 
 
 
212 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.79 
 
 
199 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.52 
 
 
191 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.9 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  30.37 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  26.57 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.05 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.57 
 
 
213 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.48 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.8 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.77 
 
 
202 aa  92  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.37 
 
 
202 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.39 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.45 
 
 
207 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.41 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.8 
 
 
199 aa  88.2  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.09 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.21 
 
 
201 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.99 
 
 
198 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  28.21 
 
 
201 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.1 
 
 
208 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.7 
 
 
216 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.1 
 
 
208 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  24.76 
 
 
213 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  29.02 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.37 
 
 
198 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.37 
 
 
198 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.97 
 
 
198 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.21 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  28.21 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  28.21 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.68 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  28.21 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  28.21 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  28.21 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  28.21 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  29.02 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  27.69 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.84 
 
 
198 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.84 
 
 
198 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1426  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.59 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.681174  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  32.52 
 
 
201 aa  85.1  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.84 
 
 
198 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  28.65 
 
 
197 aa  85.1  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.05 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  27.98 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  30.92 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  26.02 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  26.73 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.41 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  34.35 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  29.88 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.03 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  29.88 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.04 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  29.88 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.04 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.68 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  29.88 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  29.88 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.04 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.04 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.04 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  27.43 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.04 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.02 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.042412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.37 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>