285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2757 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.39 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.57 
 
 
207 aa  144  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
233 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  36.71 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.83 
 
 
213 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 
199 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.82 
 
 
199 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.33 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.9 
 
 
199 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.92 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.89 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.41 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.45 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.9 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 
239 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.92 
 
 
198 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 
198 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.92 
 
 
198 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  33.33 
 
 
210 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.14 
 
 
208 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 
198 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.39 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.92 
 
 
198 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.41 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.65 
 
 
222 aa  118  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.33 
 
 
191 aa  118  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.39 
 
 
198 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  34.65 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.85 
 
 
207 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.8 
 
 
198 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.5 
 
 
204 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.8 
 
 
198 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  35.15 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 
229 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.25 
 
 
236 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1854  (acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.85 
 
 
124 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0531258  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.45 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.35 
 
 
202 aa  111  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.72 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.33 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.28 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.64 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.28 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.28 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.28 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.28 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.29 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.28 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.28 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.89 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  32.18 
 
 
201 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.25 
 
 
193 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.5 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.86 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  32.06 
 
 
201 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.51 
 
 
216 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  32.62 
 
 
203 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  33.02 
 
 
201 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.54 
 
 
218 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  32.06 
 
 
201 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  32.06 
 
 
201 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  31.71 
 
 
201 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  33.17 
 
 
201 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  33.65 
 
 
201 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1426  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.03 
 
 
224 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.681174  normal  0.04956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.65 
 
 
201 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  33.65 
 
 
201 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  33.65 
 
 
201 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  32.58 
 
 
211 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  33.65 
 
 
201 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  33.65 
 
 
201 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  33.65 
 
 
201 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  30.27 
 
 
219 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  35.23 
 
 
208 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
199 aa  104  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.65 
 
 
201 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 
207 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 
211 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  33.65 
 
 
201 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 
208 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 
207 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 
208 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 
199 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  33.33 
 
 
192 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.08 
 
 
227 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.042412 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3076  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.65 
 
 
204 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  32.12 
 
 
201 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  32.12 
 
 
201 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  32.12 
 
 
201 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  32.12 
 
 
201 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.98 
 
 
214 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.98 
 
 
214 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.22 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  31.61 
 
 
201 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>