More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0560 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  59.69 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  59.39 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  58.46 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  51.31 
 
 		 192 aa  194  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  55.87 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50.86 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.29 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.86 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50.86 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50.86 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.43 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  46.07 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.29 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  48.04 
 
 		 196 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  48 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  48 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  48 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  48 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  48 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  48 
 
 		 198 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  48 
 
 		 198 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.86 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.86 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.2 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.81 
 
 		 196 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.43 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.5 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.71 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3728  putative acyl carrier protein phosphodiesterase  45.25 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.79 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  46.7 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.29 
 
 		 198 aa  151  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0354  FMN-dependent NADH-azoreductase 1  61.16 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.35 
 
 		 207 aa  147  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.54 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.54 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  46.29 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  45.71 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  45.71 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  45.14 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.71 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.13 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  45.71 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.54 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  45.14 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  45.14 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  45.14 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  45.14 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.75 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  44 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.58 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  44 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  44 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  43.22 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  43.43 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  41.45 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.2 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  43.02 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  43.02 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  42.42 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  41 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.57 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.28 
 
 		 207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  42.46 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.46 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  43.58 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  43.39 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  41.71 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.57 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.32 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.32 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  41.9 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.32 
 
 		 232 aa  127  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.56 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.61 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.13 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  42.94 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  37.37 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  36.87 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2923  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.67 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.09 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.09 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4167  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.44 
 
 		 208 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>