More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0307 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  79.7 
 
 		 197 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  74.62 
 
 		 197 aa  318  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  72.73 
 
 		 198 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  71.72 
 
 		 198 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  71.72 
 
 		 198 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  71.21 
 
 		 198 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  71.94 
 
 		 198 aa  296  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  71.94 
 
 		 198 aa  296  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  70.71 
 
 		 198 aa  294  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  70.26 
 
 		 197 aa  294  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  71.43 
 
 		 198 aa  293  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  69.9 
 
 		 198 aa  290  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  72.4 
 
 		 196 aa  290  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  60.51 
 
 		 194 aa  250  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  59 
 
 		 201 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  59 
 
 		 201 aa  245  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  59 
 
 		 201 aa  245  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  58.5 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  60.85 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  58.5 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  58.5 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  58.5 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  58.5 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  58.5 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  58 
 
 		 201 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  57.5 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  57.5 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  56.5 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  57.5 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  57.5 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  57.5 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  56.28 
 
 		 201 aa  238  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  56.5 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  56.5 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  56.5 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  54 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  58.85 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  55.78 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  56 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.26 
 
 		 232 aa  214  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2923  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.73 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 		 199 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.46 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.46 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.46 
 
 		 199 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.46 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4167  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.92 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.94 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.27 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  44.95 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  45.77 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.42 
 
 		 237 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.42 
 
 		 237 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.42 
 
 		 237 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.42 
 
 		 237 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.42 
 
 		 237 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.42 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.42 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.95 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  49.2 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.09 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.09 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.26 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.57 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.81 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.91 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.86 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.81 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.81 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.81 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.81 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.81 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.28 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.91 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.39 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.66 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  42.71 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.4 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.31 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.1 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  46.45 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.4 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.78 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.87 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  43.17 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.55 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  43.48 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.31 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  43.48 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.42 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  42.93 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.61 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.44 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.55 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  44.02 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.81 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>