298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3502 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  98.48 
 
 
198 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  89.56 
 
 
198 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  83.51 
 
 
198 aa  332  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  83.51 
 
 
198 aa  330  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  83.51 
 
 
198 aa  330  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  83.51 
 
 
198 aa  330  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  84.04 
 
 
198 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  81.91 
 
 
198 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  81.38 
 
 
198 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  78.17 
 
 
198 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  77.16 
 
 
198 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  77.16 
 
 
198 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  77.16 
 
 
237 aa  320  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  77.16 
 
 
237 aa  320  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  77.16 
 
 
237 aa  320  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  77.16 
 
 
237 aa  320  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  77.16 
 
 
237 aa  320  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.44 
 
 
199 aa  246  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  63.02 
 
 
199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.09 
 
 
209 aa  227  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  49.49 
 
 
199 aa  207  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.98 
 
 
213 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.97 
 
 
213 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.94 
 
 
199 aa  194  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  47.21 
 
 
201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  48.19 
 
 
201 aa  187  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  47.45 
 
 
201 aa  187  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.7 
 
 
199 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.67 
 
 
199 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  45.92 
 
 
201 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  45.92 
 
 
201 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  48.19 
 
 
201 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  45.92 
 
 
201 aa  184  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.93 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.93 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  45.64 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.23 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  45.64 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.67 
 
 
199 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  46.94 
 
 
201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.67 
 
 
202 aa  181  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  46.15 
 
 
201 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.92 
 
 
201 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  45.92 
 
 
201 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  45.92 
 
 
201 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  45.92 
 
 
201 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  45.92 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  45.92 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.21 
 
 
204 aa  178  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  45.41 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.44 
 
 
197 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.67 
 
 
200 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  45.69 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  48.09 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.76 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  48.09 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  48.09 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  48.09 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  48.09 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.69 
 
 
191 aa  171  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  48.91 
 
 
208 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.41 
 
 
232 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.88 
 
 
202 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  45.31 
 
 
213 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  44.27 
 
 
197 aa  168  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  41.62 
 
 
198 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  41.62 
 
 
198 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.71 
 
 
204 aa  167  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.88 
 
 
196 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  42.05 
 
 
198 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.37 
 
 
208 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.37 
 
 
208 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  41.12 
 
 
198 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.83 
 
 
207 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  41.54 
 
 
197 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.18 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  41.54 
 
 
197 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.18 
 
 
199 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  40.51 
 
 
198 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  40.51 
 
 
198 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  43.15 
 
 
197 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  40 
 
 
198 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  40 
 
 
198 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  40 
 
 
198 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.33 
 
 
202 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2923  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.62 
 
 
199 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660673  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.6 
 
 
200 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.78 
 
 
206 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.92 
 
 
212 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.13 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.31 
 
 
206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.22 
 
 
196 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.75 
 
 
193 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46.74 
 
 
201 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.74 
 
 
201 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  41.76 
 
 
196 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3728  putative acyl carrier protein phosphodiesterase  42.22 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.74 
 
 
201 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>