More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2707 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
200 aa  407  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 
203 aa  194  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.71 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.6 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.6 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.51 
 
 
198 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.88 
 
 
198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.88 
 
 
198 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.88 
 
 
198 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.88 
 
 
198 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.31 
 
 
198 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.99 
 
 
208 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.99 
 
 
208 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.88 
 
 
198 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.76 
 
 
198 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  44.07 
 
 
208 aa  148  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.7 
 
 
204 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.15 
 
 
204 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.9 
 
 
237 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.9 
 
 
237 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.9 
 
 
237 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.9 
 
 
198 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.9 
 
 
198 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.9 
 
 
237 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.9 
 
 
237 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
199 aa  147  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.36 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.11 
 
 
202 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.94 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.94 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.51 
 
 
201 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.51 
 
 
201 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.57 
 
 
232 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.57 
 
 
232 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.09 
 
 
201 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.2 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.88 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35.9 
 
 
199 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.62 
 
 
206 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129409  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
206 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.11 
 
 
202 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.16 
 
 
199 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
207 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.17 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.24 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.5 
 
 
207 aa  134  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.02 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.51 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.44 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  39.44 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  40.33 
 
 
206 aa  131  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.33 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  40.33 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  40.33 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  40.33 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  40.33 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.7 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  39.78 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  38.33 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.2 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  38.33 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  38.33 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.7 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  39.23 
 
 
201 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  39.78 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.05 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.16 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  38.76 
 
 
202 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  36.98 
 
 
201 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.55 
 
 
209 aa  128  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 
199 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  39.78 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  39.78 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  39.78 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  39.78 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.13 
 
 
216 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 
204 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
212 aa  127  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  39.78 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  38.89 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.62 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 
199 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 
199 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.59 
 
 
216 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
232 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.91 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  35.42 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.67 
 
 
197 aa  124  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.25 
 
 
216 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  37.36 
 
 
202 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  36.92 
 
 
198 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  36.92 
 
 
198 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  35.86 
 
 
198 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.86 
 
 
213 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40 
 
 
191 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.36 
 
 
211 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.56 
 
 
194 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  35.42 
 
 
201 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 
208 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0529615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>