More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0321 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  98.99 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  94.44 
 
 		 198 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  83.16 
 
 		 198 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  83.16 
 
 		 198 aa  342  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  83.16 
 
 		 198 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  82.65 
 
 		 198 aa  341  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  82.23 
 
 		 198 aa  340  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  75 
 
 		 197 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  70.05 
 
 		 197 aa  296  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  71.94 
 
 		 197 aa  296  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  66.67 
 
 		 197 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  65.8 
 
 		 196 aa  264  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  61.73 
 
 		 194 aa  244  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.8 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  60.8 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  60.8 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  60.8 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  60.8 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  60.8 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  59.8 
 
 		 201 aa  242  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  60.3 
 
 		 201 aa  242  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  61.73 
 
 		 213 aa  241  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  60.3 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  60.3 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  58.29 
 
 		 201 aa  234  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  57.5 
 
 		 201 aa  234  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  60.2 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  60.2 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  60.2 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  63.39 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  59.69 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  57.79 
 
 		 201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  62.84 
 
 		 201 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  62.84 
 
 		 201 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  62.84 
 
 		 201 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  62.84 
 
 		 201 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  57.79 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  54.82 
 
 		 206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.44 
 
 		 232 aa  212  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2923  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.97 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  44.22 
 
 		 237 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  44.22 
 
 		 237 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  44.22 
 
 		 237 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  44.22 
 
 		 237 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.22 
 
 		 237 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.22 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.22 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.21 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.44 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.97 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.97 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.97 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.16 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.11 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.92 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.72 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.72 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.39 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.41 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.15 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.39 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.41 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.39 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.22 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.22 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.81 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.72 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  44.39 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  49.74 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4167  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.05 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.15 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.15 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.73 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.5 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.5 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.51 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.38 
 
 		 200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.42 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.85 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.72 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  45.05 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  45.05 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.73 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  45.3 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.81 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.7 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.38 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  44.51 
 
 		 203 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  39.29 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.44 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.3 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.3 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.2 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.3 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  44.09 
 
 		 203 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>