More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4264 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
208 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
208 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  90.87 
 
 
208 aa  363  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  63.37 
 
 
214 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  63.37 
 
 
214 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  61.58 
 
 
232 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  61.58 
 
 
232 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.59 
 
 
232 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.96 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.45 
 
 
207 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  61.2 
 
 
216 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.9 
 
 
209 aa  226  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.41 
 
 
212 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  61.41 
 
 
217 aa  222  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  60.87 
 
 
203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.28 
 
 
206 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.87 
 
 
215 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  56.5 
 
 
213 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  56.08 
 
 
201 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  56.08 
 
 
201 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.17 
 
 
216 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  53.7 
 
 
216 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  54.5 
 
 
201 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50.49 
 
 
211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.2 
 
 
206 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.04 
 
 
202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.79 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  54.84 
 
 
202 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  54.84 
 
 
202 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  54.26 
 
 
201 aa  194  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  51.98 
 
 
203 aa  194  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  50.81 
 
 
206 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  53.12 
 
 
203 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
207 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.25 
 
 
195 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  53.12 
 
 
203 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  51.03 
 
 
202 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  52.6 
 
 
203 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.28 
 
 
204 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  52.33 
 
 
203 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.94 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.47 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.47 
 
 
203 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  47 
 
 
202 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  50.8 
 
 
202 aa  177  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.53 
 
 
205 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45 
 
 
199 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  48.73 
 
 
197 aa  175  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  50.8 
 
 
198 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  50.8 
 
 
198 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  47.09 
 
 
197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.34 
 
 
198 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.28 
 
 
182 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  45 
 
 
199 aa  168  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.09 
 
 
198 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.5 
 
 
199 aa  167  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.09 
 
 
198 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  47.09 
 
 
198 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.56 
 
 
198 aa  167  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.62 
 
 
198 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.96 
 
 
198 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.96 
 
 
198 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  46.08 
 
 
197 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.5 
 
 
202 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  47.96 
 
 
237 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  47.96 
 
 
237 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.96 
 
 
237 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  47.96 
 
 
237 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  47.96 
 
 
237 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.67 
 
 
206 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.62 
 
 
204 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.5 
 
 
204 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.02 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.09 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.09 
 
 
198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.46 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  48.09 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46.03 
 
 
198 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  45.92 
 
 
198 aa  161  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.5 
 
 
197 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 
198 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  46.73 
 
 
198 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  46.73 
 
 
198 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  44.16 
 
 
194 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  46 
 
 
198 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  46 
 
 
198 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  46.73 
 
 
198 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.15 
 
 
213 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  46.73 
 
 
198 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.15 
 
 
213 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.55 
 
 
201 aa  157  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  44.55 
 
 
201 aa  157  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  44.55 
 
 
201 aa  157  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  44.61 
 
 
201 aa  157  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  44.16 
 
 
213 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.63 
 
 
201 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  44.06 
 
 
201 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.51 
 
 
232 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  44.06 
 
 
201 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  44.22 
 
 
197 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>